Gibbs i McGee podczas misji specjalnej zostają zestrzeleni w helikopterze marynarki wojennej nad dzikimi terenami Rosji. Cała ekipa robi, co może, aby pomóc im bezpiecznie wrócić do domu.
Odcinek 2
Zabić posłańca
Komandor marynarki wojennej zostaje zamordowany w pobliżu Białego Domu. Gibbs i jego ludzie muszą ustalić, czy powodem były jego relacje z prezydentem — czy raczej problemy małżeńskie.
Odcinek 3
Jakoś leci
Dr Mallard i Bishop lecą do Anglii w poszukiwaniu odpowiedzi na pytanie, dlaczego pewien Anglik zamordowany w Stanach Zjednoczonych miał przy sobie listę zmarłych marynarzy.
Odcinek 4
Duszenie
Pewien naukowiec zostaje zamordowany w parku: zbójca ucina mu głowę. Gibbs i jego zespół próbują znaleźć mordercę — i szybko orientują się, że może to być wróg, z którym mieli już do czynienia.
Odcinek 5
San Dominick
Kiedy zespół NCIS jest na ćwiczeniach, Gibbs zauważa człowieka za burtą. Śledztwo prowadzi go na pokład innego statku o nazwie San Dominick, który — jak się okazuje — został przejęty przez piratów.
Odcinek 6
Opieka rodzicielska
Żona komandosa z jednostki Navy SEAL zostaje zamordowana. Okazuje się, że niedawno odwiedziła w więzieniu pewnego seryjnego mordercę, szukając jego pomocy. W jakiej sprawie?
Odcinek 7
Poszukiwacze
Badając śmierć emerytowanego sierżanta Marines, Gibbs i jego zespół odkrywają, że jego śmierć może być powiązana z historią innego żołnierza, który zaginął podczas wojny w Wietnamie.
Odcinek 8
Semper Fortis
Były sanitariusz marynarki wojennej zostaje aresztowany za praktykowanie medycyny bez licencji na miejscu wypadku samochodowego. Gibbs i spółka muszą znaleźć zabójcę — i prawnika dla sanitariusza...
Odcinek 9
Uziemieni
W przeddzień Święta Dziękczynienia DiNozzo i Bishop czekają na lotnisku — ich lot jest opóźniony z powodu pogody; okazuje się, że lotniska w Waszyngtonie są zagrożone atakiem terrorystycznym.
Odcinek 10
Zasady
McGee w świątecznym liście do ojca szczegółowo opisuje prowadzoną sprawę: zespół ściga hakerów, którzy byli odpowiedzialni za awarię Internetu w rejonie Waszyngtonu.
Odcinek 11
Kontrola
Agenci NCIS badają serię miejsc zbrodni, które wydają się być kopiami wcześniej prowadzonych spraw. Dwie byłe żony Gibbsa pojawiają się na miejscu zbrodni, aby omówić z nim ważne sprawy.
Odcinek 12
Wróg wewnętrzny
Gibbs i reszta zespołu NCIS współpracują z agentem FBI Fornellem — wspólnie ścigają urodzonego w Ameryce terrorystę, który został namierzony w Syrii, ale teraz wrócił do Waszyngtonu.
Odcinek 13
Budujemy i walczymy
Zespół Gibbsa prowadzi śledztwo w sprawie zabójstwa porucznika marynarki wojennej — homoseksualisty — który miał zostać odznaczony Medalem Honoru. Breena zaczyna rodzić.
Odcinek 14
Tempo
DiNozzo wraca do akademii wojskowej, do której uczęszczał jako nastolatek: zamordowany żołnierz Marines, absolwent szkoły, zostaje znaleziony ze zdjęciem jednego z obecnych kadetów.
Odcinek 15
Klaustrofobia
Zespół nadal tropi rosyjskiego terrorystę Siergieja. Ginie dwóch żołnierzy Marines, a agent Fornell ciężko przeżywa niedawną śmierć swojej byłej żony z rąk Siergieja.
Odcinek 16
Cień przeszłości
Okazuje się, że ofiara morderstwa przybrała fałszywą tożsamość, stworzoną dla Gibbsa, kiedy 20 lat wcześniej prowadził pewną tajną operację.
Odcinek 17
Dzieło sztuki
Adiutantka wiceadmirała zostaje zamordowana, a zespół uważa, że powodem był cenny obraz wiszący w jej biurze. Ojciec DiNozzo pomaga w śledztwie, dzieląc się swoją wiedzą na temat dzieła sztuki.
Odcinek 18
Aktualizacja
W domu żołnierza Marines zostaje znalezione ciało złodzieja. NCIS odkrywa wizytówkę grupy terrorystycznej, którą od dawna śledzili Delilah i Departament Obrony USA.
Odcinek 19
Cierpliwość
Morderstwo bosmana dostarcza nowych wskazówek na temat nierozwiązanej od 40 lat sprawy zamachu bombowego na lotnisku — sprawy, którą Gibbs i DiNozzo niedawno ponownie analizowali.
Odcinek 20
Żaden dobry uczynek...
Okazuje się, że narzędzie zbrodni badanej przez NCIS zostało pierwotnie zakupione na potrzeby kontrowersyjnej akcji ATF. DiNozzo współpracuje ze swoją dziewczyną, agentką specjalną ATF Zoë Keates.
Odcinek 21
Problemy z tłumaczeniem
Gibbs i Bishop lecą do Afganistanu, gdy śledztwo w sprawie morderstwa prowadzi ich do grupy terrorystycznej, która przetrzymuje jako zakładnika żołnierza Marines.
Odcinek 22
Troll
Zamordowany zostaje chorąży marynarki, który pracował w Biurze Wywiadu Marynarki Wojennej. Zespołowi Gibbsa pomaga agent specjalny Ned Dorneget z NCIS Cyber Operations.
Odcinek 23
Zaginieni
W czasie śledztwa prowadzonego przez NCIS Cyber Operations okazuje się, że grupa terrorystyczna The Calling kupowała niemieckie miny na czarnym rynku. Zespół Gibbsa wkracza do akcji.
Odcinek 24
Nibylandia
Za granicą dochodzi do zamachu bombowego — zespół ponosi bolesną stratę. Teraz agenci NCIS śledzą globalną grupę terrorystyczną, która rekrutuje nastolatków przez Internet.